中国科学院院长路甬祥在两院院士大会上提出，要把中科院学部建设成国家科学思想库。此说颇为引人注目。在大会期间，路甬祥接受了记者的采访，就这一设想产生的背景和意义做了阐述。
路甬祥说，在进入千年世纪之交的时候，我国将胜利实现第二步战略目标，并开始向第三步战略目标迈进。江泽民总书记在十五大报告中，对科学技术工作予以高度重视，精辟地论述了实现第三步战略目标必须实施科教兴国战略和可持续发展战略，朱基总理在九届人大一次会议闭幕后的记者招待会上郑重宣告：“科教兴国是本届政府最大的任务。”这种新的形势对中国科学院学部提出了新的更高的要求，因此，我们要抓住这个大好机遇，实现中科院学部的跨世纪发展，为科教兴国做出自己的贡献。
关于国家科学思想库，路甬祥说，国外也有类似提法，如美国的科学院、工程院、医学科学院也承担着科学思想库的任务，他们组成了一个联合组织，在美国的重大发展计划、重大决策前进行评估论证。法国科学院、英国皇家科学院也做这方面的工作。我国也非常重视这一工作，在国家、区域发展的重大决策前，都曾请科学家参与评价论证。
路甬祥说，建设国家科学思想库，就是要建成最有影响的国家宏观决策科技咨询系统。在跨世纪发展中，国家有许多战略性、前瞻性的重大问题，需要科技界积极参与决策咨询；政府部门在作出各种重要决定之前，需要经过科学的咨询和论证；现代社会的健康发展，需要科技界严谨的科学思考。历史上的成功经验，如制定12年科学发展计划、建立科学基金制和决策实施“863计划”等，皆源自于中科院学部和院士的建议；历史的惨痛教训，如批判马寅初的人口论、批判孟德尔—摩尔根的基因学说等，皆因没有倾听科学界的声音。
路甬祥认为，提出国家科学思想库，是进一步强化了它的咨询功能。国家科学思想库存在于数百位院士的创作组合中。由于院士都是各学科各方面的高层次专家，这种多学科人才的组合优势，绝不仅仅起1＋1等于2的作用，它是一种动态组合，将能体现出群体的组合优势。同时，这个思想库还应是一个开放的体系，它不仅包括科学家，也包括社会科学家和管理人员等各方面人才。建设国家科学思想库，就是要充分发挥院士的群体优势，加强科技战略研究，重点做好对国家宏观科技政策、科学技术发展规划、学科发展战略的制定以及经济建设、社会发展中重大科技问题的咨询工作。突出的重点是战略性、前瞻性和针对性。要不断提高咨询工作的质量和水平，使这项工作对我国长远发展能真正起到预测、预警作用，或成为重大决策的重要依据。国家科学思想库是个广义的概念，路甬祥强调说，它包括科学家对关系国计民生的重大问题主动提出意见建议，如提出关于中国水问题的出路的研究建议等，也包括从科学研究开发到科学技术产业化整个链条的各个环节，都要加强研究，还包括通过院士评议，发现重要研究方向、创新学术思想和优秀人才等等。
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